Qendra për Studime Evropiane synon të rrisë rolin e saj si një qendër e drejtuar nga kërkimi që prodhon kërkime ndërkombëtare të dukshme, relevante për politikat dhe ndërdisiplinore mbi studimet e BE-së, me fokus të veçantë në Ballkanin Perëndimor. Ai promovon kërkime që hulumtojnë proceset e integrimit evropian dhe bashkëpunimit nga një këndvështrim politik, ekonomik, social dhe kulturor; analizon zhvillimin e politikave dhe institucioneve të BE-së në kohë; dhe forma të ndryshme bashkëpunimi dhe konflikti që karakterizojnë marrëdhëniet e unionit me shtetet dhe rajonet. Më konkretisht, qendra mbështet fuqimisht punimet kërkimore që studiojnë progresin e Shqipërisë për axhendën e BE-së dhe sfidat e integrimit që janë specifike për rajonin e Ballkanit Perëndimor.
Qendra për Studime Evropiane synon të forcojë profilin dhe rrjetet e saj ndërkombëtare nëpërmjet bashkëpunimeve të qëndrueshme dhe pjesëmarrjes aktive në rrjetet akademike dhe të politikave evropiane. Ai fokusohet në zhvillimin dhe thellimin e bashkëpunimit dhe partneriteteve nëpërmjet projekteve të BE-së dhe mundësive të tjera të financimit rajonal. Si një vend në tranzicion, CES e forcon nevojën për të mësuar nga përvoja dhe ekspertiza e institucioneve dhe profesionistëve të vendosur në vendet e BE-së.
Qendra për Studime Evropiane synon të përkthejë njohuritë akademike në vlerë shoqërore duke angazhuar politikëbërës, shoqërinë civile dhe publikun e gjerë.